Der Fenchel wird hauptsächlich bei Verdauungs- und Atemwegsbeschwerden angewandt. Mischt man ihn mit Kümmel, so erhält man eine intensivere Wirkung, wobei der Fenchel den Geschmack sehr positiv beeinflusst. Besonders in den Fenchelsamen ist ein ätherisches Öl enthalten.
Der Fenchel ist vor allem in der Säuglingspflege gut bekannt, da er eine übermäßige Gasbildung im Magen verhindert (weniger Aufstoßen) und den Abgang von Darmgasen fördert und somit blähungsmindernd wirkt. Er regt die peristaltischen Bewegungen des Darms an., unterstützt die Entleerung des Magens und fördert die gesamte Verdauung. Gleichzeitig wirkt er milchtreibend. Bei chronischer Bindehautentzündung helfen auch Augenwaschungen bzw. -bäder.
Fenchel hilft bei